معاونت مالی واداری پوهنتون بدخشان، دارای ساختار ذیل میباشد:
- آمریت امور کارکنان؛
- آمریت نشرات، ارتباط و آگاهی عامه؛
- آمریت تکنالوژی معلوماتی؛
- آمریت خدمات؛
- آمریت مالی و حسابی؛
- مدیریت عمومی مالی و حسابی؛
- مدیریت حوالهجات؛
- مدیریت معاشات؛
- مدیریت عمومی لیلیه‌ها؛
- مدیریت عمومی حفظ و مراقبت؛
- مدیریت عمومی انکشاف اداره؛
- مدیریت شبکه؛
- مدیریت ویدیو کنفرانس؛
- مدریت استخدام؛
- مدیریت سوانح و دیتابیس؛
- مدیریت حاضری؛
- مدیریتHRMIS ؛
- و بست‌های متعدد دیگر.
معاونت مالی و اداری پوهنتون بدخشان در روشنایی قانون، مقررات، لوایح و طرزالعمل‌های وزارت محترم تحصیلات عالی کشور در عرصه‌های مختلف مالی - اداری کار و فعالیت مینماید.
وظایف و صلاحیت‌های معاونت مالی و اداری:
- همکاری با رئیس پوهنتون در بخش‌های مالی، اداری و خدماتی؛
- ارایه‌ی مشوره‌ی لازم به رئیس پوهنتون در بخش‌های مالی، اداری و خدماتی؛
- اجراآت قانونی پیرامون تقرر، ترفیع و انفکاک اعضای اداری پوهنتون،
- اجراآت قانونی در رابطه به اجرای حقوق تقاعدی منسوبین پوهنتون،
- رهبری و نظارت از فعالیت‌ها و اجراآت دفترهای مربوطه؛
- اجراآت قانونی در موارد مالی، حسابی، خریداری‌ها، قید و جمع اموال و اجناس و سایر امور مالی، اداری، خدماتی، از جمله فراهم‌آوردن تسهیلات مناسب ترانسپورتی جهت انتقال منسوبین پوهنتون و اجرای فعالیت‌های آموزشی به طور مؤثر و سهل؛
- کار بالای بودجه‌ی عادی و انکشافی پوهنتون با درنظرداشت نیازمندی‌ها و انکشافات؛
- نظارت از امور مربوط به حفظ و مراقبت ساختمان‌ها، ساحه‌ی سبز و سایر بخش‌های مربوطه؛
- اجراآت قانونی در مورد دارایی‌ها و مالکیت‌های پوهنتون؛
- تأمین شرایط حفظ‌الصحه، پاکی و صفایی در ساختمان‌ها و محیط مربوط به پوهنتون؛
- تهیه و ترتیب آمار و احصائیه‌های مربوطه؛
- انکشاف تدابیر مؤثر و همه‌جانبه در امور مربوط به برق‌رسانی، آب‌رسانی، گرم نمودن ساختمان‌ها، فعالیت‌های سالم کفتریا و نظارت از اجراآت دفترهای مختلف در این زمینه‌ها؛
- طرح پلان‌ها و برنامه‌های کاری برای انکشاف زیرساخت‌های فزیکی پوهنتون؛
- طرح پلان‌ها و برنامه‌های کاری جهت ایجاد و تشویق فعالیت‌های انتفاعی و طی مراحل استفاده از آن بخاطر انکشاف و حل مشکلات پوهنتون در تفاهم با معاونت‌های دیگر و دانشکده‌ها؛
- ارائه‌ی گزارش از فعالیت‌های مربوط به ریاست و شورای اداری پوهنتون؛
- هماهنگ ساختن اجراآت در رابطه به تقرر و انفکاک اعضای اداری پوهنتون؛
- فراهم نمودن امکانات و سهولت های لازم برای اجرای کارهای عملی برای کارمندان؛
- سایر وظایف که طبق موازین قانونی به معاون مالی و اداری تعلق می‌گیرند؛